1. يقوم الصندوق بالإعلان عن شروط المشاريع ذات الاولويات البيئية والجدول الزمني للدورة في الصحف اليومية وتنشر على الموقع الالكتروني للوزارة في نهاية شهر آذار من كل عام.
2. يتم تعبئة استمارة الدعم للمشاريع في صندوق حماية البيئة ويرفق به كافة الوثائق الخاصة بالمشروع و/أو أية مستندات اضافية.
3. يتم استيفاء الرسوم بدل استقبال الطلبات بواقع (100) دينار لكل طلب في قسم المحاسبة.
4. يقوم مدير الصندوق بدراسة وتدقيق الوثائق المرفقة بالطلب، حيث يتم استبعاد الطلبات الغير مستوفية للشروط، أما الطلبات التي استوفيت الشروط يتم عرضها على اللجنة الفنية.
5. تقوم اللجنة الفنية بفرز المشاريع المقدمة و توزيعها على اللجان المختصة.
6. تقوم اللجان المختصة بدراسة وتقييم المشاريع حسب الية معتمدة للصندوق.
7.  يقوم مدير الصندوق بعرض توصيات اللجان على لجنة إدارة الصندوق وذلك للمصادقة والموافقة عليها.
8. يقوم المدير بإجازة صرف مبالغ الدعم الموافق عليها لصرفها وتحول للمدير الإداري وذلك لصرف الدعم المالي.
9. يتم تسليم الدعم المالي للجهة التي استحقت الدعم.

الوثائق المطلوبة من جميع الجهات

ملخص المشروع.

ميزانية المشروع التقديرية.

دراسة الجدوى الاقتصادية والمجتمعية والأثر البيئي.

الوثائق الاضافية المطلوبة من القطاع العام

شهادة تثبت رصد مبلغ مشاركة القطاع العام بتمويل المشروع ضمن مخصصات الجهة طالبة الدعم.

الوثائق الاضافية المطلوبة من القطاع الخاص والجمعيات الغير حكومية

صورة عن شهادة التسجيل من وزارة الصناعة والتجارة.

كشف حساب بنكي لمدة 6 أشهر سابقة.

شهادة تثبت اشتراك 10 موظفين كحد أدنى بالضمان الاجتماعي